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ATP熒光檢測儀實現了對食品微生物含量的檢測，可用于檢測食品中的微生物。儀器基于螢火蟲發光的原理，可以快速檢測ATP。因為所有的活細胞都含有恒定量的ATP，所以檢測ATP含量可以清楚地表明樣品中微生物的數量，判斷樣品的衛生狀況。
在食品出廠前檢測食品中的微生物很重要，食品中的微生物根據是否對人體有害可分為兩類：一類是有益菌，可用于食品加工生產。另一類是有害細菌，會引起食物中毒或傳染病。因此，食品中的細菌總數和大腸菌群都進行了標準定義。由于所有活細胞都含有衡量ATP，ATP含量可以清楚地反映出測試樣品中的微生物含量，從而判斷其衛生狀況。
食品中含有的微生物是導致食品變質的主要因素，人們日常生活中各種食物的存放方式也是為了防止微生物在食物中滋生，加速食物變質，然而，微生物無處不在。ATP熒光檢測儀用于檢測食品中的微生物，對食品進行微生物檢測，有利于保證產品的安全性，防止變質的食品在市場上銷售。
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